Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and Rifampin Resistance, Molecular Detection, Sputum
Test Catalog Information
| Test Catalog Synonyms | |
| EPIC Synonyms |
MTBPCR MTB and Rifampin PCR TB PCR |
| Cerner Primary Mnemonic | MTB and Rifampin PCR |
| EPIC Display Name | Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and Rifampin Resistance, Molecular Detection, Sputum |
| Allscripts (AEHR) Order Name | MTB PCR AND RIF RESISTANCE |
| Sunrise Clinical Manager (SCM) Order Name | Mycobacterium Tuberculosis Complex PCR and RIF |
| EPIC Inpatient Orderable | Yes |
| EPIC Outpatient Orderable | Yes |
| Cerner Results |
Rifampin Resistance Source MTB MTB PCR Interpretation Rifampin Resistance Interpretation M. tuberculosis complex |
| Clinical Info | |
| Specimen Type |
Sputum |
| Container |
AFB Coll Kit |
| Collection Instructions |
Sputum 1. Collect 5-8 mL (minimum volume: 3 mL) of a first-morning “deep cough” sputum specimen into a Sputum Collection Kit. 2. Instruct patient to brush his/her teeth and/or rinse mouth well with water to minimize contaminating specimen with food particles, mouthwash, or oral drugs. 3. Have patient remove dentures. 4. Instruct patient to take a deep breath, hold it momentarily, then cough deeply and vigorously into Sputum Collection Kit or sterile container. 5. Label container with patient’s name (first and last), date and actual time of collection, and type of specimen. 6. Send specimen refrigerated. 7. Maintain sterility and forward promptly. First time positive sputum smear with acid-fast bacilli will automatically have MTBPCR performed. *Rejection Criteria: Quantity not sufficient, specimen other than sputum, specimen leaking, unlabeled or mislabeled specimen, sputum with visible food or solid particles, specimen without a minimum of 2 patient identifiers, specimen received after prolonged delay (more than 7 days), specimen in fixative. Note: 1. Grossly bloody specimen may inhibit assay. |
| Transport Instructions | |
| Specimen Stability |
Up to 7 days at 2-8C (refrigerated) |
| Methodology |
Real-time PCR Detects Mycobacterium tuberculosis complex MTB PCR and rifampin resistance detection (MTB/RIF assay by GeneXpert®) is an amplified nucleic acid test that uses PCR for the qualitative detection and identification of Mycobacterium tuberculosis Complex DNA in sputum. The assay will detect but not differentiate between the species of the MTB-complex (i.e., M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum, M. canettii, M. microti, M. caprae, M. pinnipedi, M. mungi, and M. orygis). This assay also will detect mutations of the rpoB gene associated with rifampin resistance. Resistance to rifampin is often an indication of multidrug resistance to tuberculosis. Molecular resistance detection must be confirmed by a reference laboratory (NYS-DOH). |
| Days Performed |
Results available within 72 hours of receipt. Test performed on mycobacteria culture processed specimen. |
| Performing Laboratory |
Northwell Health Laboratories |
| CPT |
87556,87798 |
| PDM |
1562067 |
Desired Epic Build Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and Rifampin Resistance, Molecular Detection, Sputum
| Cerner Primary Mnemonic: | MTB and Rifampin PCR | ||||||||||||||||||
| PDM | 1562067 | ||||||||||||||||||
| Informatics - Workgroup | ID Molecular | ||||||||||||||||||
| Synonyms * | MTBPCR MTB and Rifampin PCR TB PCR | ||||||||||||||||||
| Display Name * | Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and Rifampin Resistance, Molecular Detection, Sputum | ||||||||||||||||||
| Order Entry Specimen Sources * |
Expectorated Sputum
Induced Sputum
| ||||||||||||||||||
| Order Entry Specimen Types |
Respiratory
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| Specimen Navigator Specimen Types | |||||||||||||||||||
| Specimen Navigator Specimen Sources | |||||||||||||||||||
| Specimen Navigator Short Name | PCR MTB/rifampin | ||||||||||||||||||
| Ordering info (EPIC SmartText) | |||||||||||||||||||
| IP Orderable | Yes | ||||||||||||||||||
| OP Orderable | Yes | ||||||||||||||||||
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AOEs * | |||||||||||||||||||
| AP AOEs | |||||||||||||||||||
| Special History | No | ||||||||||||||||||
| Build Comments | |||||||||||||||||||
| Filter * | |||||||||||||||||||
| Procedure Category Change | |||||||||||||||||||
Cerner Results
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Actual Epic build
| Procedure Id | 115919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pdm | 1562067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Display Name | Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and Rifampin Resistance, Molecular Detection, Sputum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Procedure Name | MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS COMPLEX PCR AND RIF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Procedure Master Number | LAB11839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Short Procedure Name | MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS COMPLEX PCR AND RIF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category Code | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category Code Record Name | LAB MICROBIOLOGY - GENERAL ORDERABLES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | MTBPCR MTB AND RIFAMPIN PCR TB PCR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clinically Active | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orderable | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Performable | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Filter Genomics | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference Link Url | https://labs.northwell.edu/epic/test/115919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ordering Instructions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Default Specimen Type | Respiratory | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Type Pick List | Respiratory | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Type List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Specimen Type List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Pick List | Expectorated Sputum Induced Sputum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Default - Male | Induced Sputum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Default - Female | Induced Sputum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ip Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Questions | [] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Order Questions | [] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Order Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Specific Question Override | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Question Override | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Ip Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Include Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Op | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Op Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Includes Op | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Amb Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Specimen Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Op Specimen Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Specimen Type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Op Specimen Type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Ip Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Ip Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Op Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Op Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ip Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EPIC OP AOEs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EPIC IP AOEs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC Components (results)
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