Gastrointestinal Pathogen Panel Molecular Detection
Test Catalog Information
| Test Catalog Synonyms | |
| EPIC Synonyms |
stool Rotavirus GI PCR Panel Stool stool culture GI PCR GPP Norovirus |
| Cerner Primary Mnemonic | GI PCR Panel Stool |
| EPIC Display Name | Gastrointestinal Pathogen Panel Molecular Detection |
| Allscripts (AEHR) Order Name | GI PCR Panel, Stool |
| Sunrise Clinical Manager (SCM) Order Name | GI PCR Panel Stool |
| EPIC Inpatient Orderable | Yes |
| EPIC Outpatient Orderable | Yes |
| Cerner Results |
Salmonella Enterotoxigenic E.coli (ETEC) lt/st E. coli O157 Sapovirus (Genogroups I, II, IV, and V) Vibrio Enteroaggregative E. coli (EAEC) Plesiomonas shigelloides Cyclospora Campylobacter Adenovirus F 40/41 Norovirus GI/GII GI PCR Panel Shigella/ Enteroinvasive E. coli Cryptosporidium Yersinia Enterocolitica Entamoeba histolytica Giardia lamblia Vibrio Cholerae Enteropathogenic E. coli (EPEC) Rotavirus A Astrovirus Shiga-like toxin-producing E.coli (STEC) |
| Clinical Info |
For the multiplexed molecular detection of multiple bacteria, viruses and parasites directly from stool samples in Cary-Blair transport media obtained from individuals with signs and/or symptoms of gastrointestinal infection. If Shigella, Salmonella, Vibrio, Yersinia, STEC or E. coli O157 are detected, culture will be performed. Antibiotic susceptibility testing will be performed for Shigella, S. typhi, S. paratyphi, and Yersinia. Serial stool collections will not be accepted. This test is not recommended as a test of cure. |
| Specimen Type |
Stool |
| Container |
Cary Blair |
| Collection Instructions |
Container/Tube: Cary-Blair transport media Specimen: Random Stool Transport Temperature: Refrigerated or room temperature up to 4 days Collection Instructions: Stool specimens collected in Cary Blair transport media. Add stool until level in Cary Blair vial is at fill-line on vial. Do not over fill. Cary Blair is transported and stored at room temperature or refrigerated at 2-8°C.Reject any Cary Blair greater than 4 days old. Stool received in a cup must be transferred to a Cary Blair transport media within 24h. Transfer stool up to the fill line on the transport media (approximately 1 gram). 200 μL of sample is required for testing. Collect only one specimen. Repeat testing may be performed after 14 days, if necessary. |
| Transport Instructions | |
| Specimen Stability |
Refrigerated or room temperature up to 4 days |
| Methodology |
he FilmArray gastrointestinal panel (GI PCR Panel, Stool) is a multiplex PCR test that detects 22 pathogens (bacteria, parasites, and viruses) from stool in Cary Blair transport medium.(BioFire) The pathogens detected on this panel are: Campylobacter species, Plesiomonas shigelloides, Salmonella species, Vibrio sp., V. cholerae, Yersinia enterocolitica, Enteroaggregative Escherichia coli, Enteropathogenic E. coli, Enterotoxigenic E. coli, Shiga toxin-producing E coli, E coli O157, Shigella/Enteroinvasive E. coli, Cryptosporidium sp., Cyclospora sp., Entamoeba histolytica, Giardia lamblia, Adenovirus 40/41, Astrovirus, Norovirus GI/GII, Rotavirus A and Sapovirus. |
| Days Performed | |
| Performing Laboratory |
Northwell Health Laboratories- Little Neck |
| CPT |
CPT- 87507 Loinc - 82195-9 |
| PDM |
2162433 |
Desired Epic Build Gastrointestinal Pathogen Panel Molecular Detection
| Cerner Primary Mnemonic: | GI PCR Panel Stool | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDM | 2162433 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Informatics - Workgroup | ID Molecular | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms * | stool Rotavirus GI PCR Panel Stool stool culture GI PCR GPP Norovirus | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Display Name * | Gastrointestinal Pathogen Panel Molecular Detection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Entry Specimen Sources * |
Stool
Stool
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| Order Entry Specimen Types |
Stool
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| Specimen Navigator Specimen Types | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Navigator Specimen Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Navigator Short Name | PCR GI/Stool | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ordering info (EPIC SmartText) | For the multiplexed molecular detection of multiple bacteria, viruses and parasites directly from stool samples in Cary-Blair transport media obtained from individuals with signs and/or symptoms of gastrointestinal infection. If Shigella, Salmonella, Vibrio, Yersinia, STEC or E. coli O157 are detected, culture will be performed. Antibiotic susceptibility testing will be performed for Shigella, S. typhi, S. paratyphi, and Yersinia. Serial stool collections will not be accepted. This test is not recommended as a test of cure. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IP Orderable | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OP Orderable | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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AOEs * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| AP AOEs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Special History | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Build Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Filter * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Procedure Category Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cerner Results
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Actual Epic build
| Procedure Id | 126560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pdm | 2162433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Display Name | Gastrointestinal Pathogen Panel Molecular Detection | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Procedure Name | GASTROINTESTINAL PANEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Procedure Master Number | LAB1901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Short Procedure Name | GASTROINTESTINAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category Code | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category Code Record Name | LAB MICROBIOLOGY - GENERAL ORDERABLES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | STOOL ROTAVIRUS GI PCR PANEL STOOL STOOL CULTURE GI PCR GPP NOROVIRUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clinically Active | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orderable | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Performable | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Filter Genomics | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference Link Url | https://labs.northwell.edu/epic/test/126560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ordering Instructions |
For the multiplexed molecular detection of multiple bacteria, viruses and parasites directly from stool samples in Cary-Blair transport media obtained from individuals with signs and/or symptoms of gastrointestinal infection.
If Shigella, Salmonella, Vibrio, Yersinia, STEC or E. coli O157 are detected, culture will be performed. Antibiotic susceptibility testing will be performed for Shigella, S. typhi, S. paratyphi, and Yersinia. Serial stool collections will not be accepted. This test is not recommended as a test of cure. |
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| Default Specimen Type | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Type Pick List | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Type List | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Specimen Type List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Pick List | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Default - Male | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source Default - Female | Stool | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ip Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Questions | ["3045300170", "3045300171", "3045300173"] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Questions Record Name | NH IP HOME COLLECT DATE NH IP HOME COLLECT DAYS NH IP HOME COLLECT MEDICALLY NECESSARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Order Questions | [] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Order Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Order Specific Question Override | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inpatient Question Override | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Ip Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Include Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Op | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Op Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location Restrict List Includes Op | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Amb Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Specimen Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Op Specimen Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Ip Specimen Type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Edp Op Specimen Type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Ip Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Ip Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Op Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Derived Edp Op Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ip Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Op Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC OP AOEs
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| EPIC IP AOEs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC Components (results)
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