Pneumocystis jirovecii, Molecular Detection
Test Catalog Information
Test Catalog Synonyms | |
EPIC Synonyms | Pneumocystis jiroveci PCR |
Cerner Primary Mnemonic | Pneumocystis jiroveci PCR |
EPIC Display Name | Pneumocystis jirovecii, Molecular Detection |
Allscripts (AEHR) Order Name | Pneumocystis jiroveci PCR |
Sunrise Clinical Manager (SCM) Order Name | Pneumocystis jiroveci PCR |
EPIC Inpatient Orderable | Yes |
EPIC Outpatient Orderable | Yes |
Cerner Results |
Specimen Source Pn Report Status Pneumocystis PCR Special Information |
Clinical Info |
Preferred test for detection of Pneumocystis |
Specimen Type | |
Container |
Sterile |
Collection Instructions |
Specimen must arrive within 7 days of collection; specimens older than 7 days will be rejected. The high sensitivity of amplification by PCR requires the specimen to be processed in an environment in which contamination of the specimen by Pneumocystis species DNA is unlikely. Submit only 1 of the following specimens: Preferred Specimen Type: Body fluid Sources: Pleural Container/Tube: Sterile container Specimen Volume: 1 mL 0.5 mL min) Specimen Type: Respiratory Sources: Bronchoalveolar lavage, bronchial washing, tracheal secretions, or sputum Container/Tube: Sterile container Specimen Volume: 1 mL (0.5 mL min) Specimen Type: Tissue Sources: Respiratory Container/Tube: Sterile container Specimen Volume: 5-10 mm Collection Instructions: 1. Submit fresh tissue. 2. Keep tissue moist with sterile water or sterile saline Acceptable Specimen Type: NALC/NaOH-digested respiratory specimens Sources: Lavage fluid, bronchial washing, respiratory fluid, sputum, or tracheal secretion Container/Tube: Sterile container Specimen Volume: 2 mL Rejection: Body fluid other than pleural fluid, blood, bone, non-respiratory tissue, bone marrow, organ tissues other than lung, paraffin-embedded tissue Specimen in anaerobe vial or viral transport medium Feces Swab Tissue in formalin fluid Urine Specimen;<7 days old |
Transport Instructions | |
Specimen Stability |
7 Days Refrigerated 7 Days Frozen |
Methodology |
Real-Time Polymerase Chain Reaction (PCR) |
Days Performed |
TAT: 2 -4 Days |
Performing Laboratory |
Mayo Medical Laboratories |
CPT |
87798 LOINC Code: 89996-3 |
PDM |
1959069 |
Desired Epic Build Pneumocystis jirovecii, Molecular Detection
Cerner Primary Mnemonic: | Pneumocystis jiroveci PCR | |||||||||||||||
PDM | 1959069 | |||||||||||||||
Informatics - Workgroup | ID Sendouts | |||||||||||||||
Synonyms * | Pneumocystis jiroveci PCR | |||||||||||||||
Display Name * | Pneumocystis jirovecii, Molecular Detection | |||||||||||||||
Order Entry Specimen Sources * |
BAL
Expectorated Sputum
Induced Sputum
Lung LLL
Lung LUL
Lung RLL
Lung RML
Lung RUL
Pleura L
Pleura R
Trachea
| |||||||||||||||
Order Entry Specimen Types |
Respiratory
Tissue
| |||||||||||||||
Specimen Navigator Specimen Types | ||||||||||||||||
Specimen Navigator Specimen Sources | ||||||||||||||||
Specimen Navigator Short Name | ||||||||||||||||
Ordering info (EPIC SmartText) | Preferred test for detection of Pneumocystis | |||||||||||||||
IP Orderable | Yes | |||||||||||||||
OP Orderable | Yes | |||||||||||||||
AOEs * | ||||||||||||||||
AP AOEs | ||||||||||||||||
Special History | No | |||||||||||||||
Build Comments | ||||||||||||||||
Filter * | micro | |||||||||||||||
Procedure Category Change | ||||||||||||||||
Cerner Results
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Current Actual EPIC Build as of 10/28/2024
Procedure Id | 111444 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Pdm | 1959069 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Order Display Name | Pneumocystis jirovecii, Molecular Detection | ||||||||||||||||||||||||||||||
Procedure Name | PNEUMOCYSTIS JIROVECI PCR | ||||||||||||||||||||||||||||||
Procedure Master Number | LAB10470 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Short Procedure Name | PNEUMOCYSTIS JIROVECI PCR | ||||||||||||||||||||||||||||||
Category Code | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Category Code Record Name | LAB BLOOD ORDERABLES | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PNEUMOCYSTIS JIROVECI PCR | ||||||||||||||||||||||||||||||
Clinically Active | |||||||||||||||||||||||||||||||
Orderable | |||||||||||||||||||||||||||||||
Performable | |||||||||||||||||||||||||||||||
Filter Genomics | |||||||||||||||||||||||||||||||
Reference Link Url | https://labs.northwell.edu/epic/test/111444 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ordering Instructions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Default Specimen Type | Respiratory | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Type Pick List | Respiratory Tissue | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Type List | |||||||||||||||||||||||||||||||
Op Specimen Type List | |||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Source Pick List | BAL Expectorated Sputum Induced Sputum Lumbar Puncture Lung, Left Lower Lobe Lung, Left Upper Lobe Lung, Left Middle Lobe Lung, Right Lower Lobe Lung, Right Middle Lobe Lung, Right Upper Lobe Nares Nasopharynx Oropharynx/Throat Pericardium Pleura, Left Pleura, Right Trachea | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Source Default - Male | BAL | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Source Default - Female | BAL | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||
Op Specimen Source List | |||||||||||||||||||||||||||||||
Ip Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||
Op Lab Test Components For Report | |||||||||||||||||||||||||||||||
Order Questions | [] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Order Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Inpatient Order Questions | [] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Inpatient Order Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Order Specific Question Override | |||||||||||||||||||||||||||||||
Inpatient Question Override | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Ip Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Include Ip | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Op | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Op Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Location Restrict List Includes Op | |||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Amb Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Ip Order Specific Questions Record Name | |||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Ip Specimen Source | Blood, Venous Blood, Central Line Blood, Arterial Blood, Capillary | ||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Op Specimen Source | |||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Ip Specimen Type | Blood | ||||||||||||||||||||||||||||||
Edp Op Specimen Type | |||||||||||||||||||||||||||||||
Derived Edp Ip Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||
Derived Edp Ip Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||
Derived Edp Op Buttons S | |||||||||||||||||||||||||||||||
Derived Edp Op Buttons T | |||||||||||||||||||||||||||||||
Ip Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Op Orderable | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC OP AOEs | |||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC IP AOEs | |||||||||||||||||||||||||||||||
EPIC Components (results)
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